Cada una de las proteínas, de hecho, posee una compleja y única estructura tridimensional, que condiciona todo aquello que está en grado de hacer: para desenredar esta maraña pueden pasar meses, o incluso años, pero el problema fue resuelto por AlphaFold, que con su segunda versión, lanzada en 2020, alcanzó un elevado nivel de precisión.
El objetivo era acelerar los descubrimientos científicos en todos los campos, desde la lucha contra las enfermedades hasta aquella contra la contaminación, y en pocos años este valioso instrumento dio lugar a una explosión de datos para la investigación.
Los 200 millones de proteínas incluyen casi todas aquellas conocidas por la ciencia, provenientes de más de un millón de organismos, entre seres humanos, animales, plantas, bacterias y otros.
Estos datos están disponibles gratuitamente en la base de datos de AlphaFold, creada en 2021 gracias a la colaboración con el Instituto Europeo de Bioinformática del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (Embl-Ebi), y que ahora cuenta con más de 2 millones de usuarios en 190 países.
Solo un año después de su creación, más de 1.000 artículos científicos ya habían citado la base de datos, y muchos más fueron agregados desde entonces.
El programa de IA basado en AlphaFold fue entrenado con los datos obtenidos de todas las secuencias sabidas de aminoácidos, los ladrillos básicos que componen las proteínas.
Cuando una secuencia con estructura desconocida es introducida en el programa, la IA revisa su archivo en busca de todas las moléculas similares, y las compara.
En el siguiente paso, trata de entender cómo los aminoácidos individuales pueden interactuar entre sí en el espacio, creando un mapa de sus posiciones y construyendo progresivamente la estructura en 3D.
Por último, AlphaFold reúne el rompecabezas y, después de varios controles, llega a proponer una estructura definitiva.
En mayo de este año, Google DeepMind dio un paso más con la publicación de AlphaFold 3, que, además de la estructura de las proteínas, es capaz de predecir la estructura de todas las moléculas biológicas, empezando por el ADN.
En mayo de 2024, esta tercera versión desató las protestas de los investigadores, que no habían obtenido el código prometido por la compañía para acceder al instrumento.
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